《超级机器人大战》系列总制作人寺田贵信在接受巴哈姆特采访时表示，虽然本次《超级机器人大战V》中收录了会前往外宇宙的《宇宙战舰大和号》和《机动战舰》等作品，但本作的主战场不会是只有宇宙，地球的剧情也将会很吃重，整体来说约各占一半。故事一开始玩家会随着“大和号”一同启航，陆续会加入《勇者特急队》、《机动战舰》。在中途开始一行人会分头行动，所以不会全部队伍都往外宇宙出发，例如是《勇者特急队》、《惊爆危机》和《Cross Ange ～天使与龙的轮舞～》的主战场都在地球。
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